Locus

Większość dotychczas omawianych przykładów dotyczyło loci reprezentowanych tylko przez dwa allele. Faktycznie, każdy organizm diploidalny ma maksymalnie dwa różne lub takie same allele każdego genu, a haploidalna gameta tylko jeden. Jeśli jednak przyjrzymy się całej populacji danego gatunku, może się okazać, ze występuje w niej więcej niż dwa allele dla badanego locus, czego przykładem może być omówiony wcześniej układ grup krwi ABO. Jeśli dany gen ma trzy lub więcej alleli, to nazywamy je allelami wielokrotnymi. Badania wykazały, że istotnie jest wiele takich loci. Niektóre allele wielokrotne warunkują po prostu izoformy jakiegoś enzymu lub inne biochemiczne i fizjologiczne cechy organizmu. Inne przejawiają się w łatwo zauważalnych cechach zewnętrznych, takich jak barwa sierści, przy czym często wykazują względem siebie zależność typu dominacja-recesywność. U królika jeden z genów warunkujących barwę sierści ma cztery allele. Allel C powoduje typowe ciemnopopielate zabarwienie futra. Homozygota recesywna cc jest albinosem - białym królikiem d czerwonych oczach.