Roznice w syntezie

Jakkolwiek podstawowe mechanizmy transkrypcji i translacji są bardzo podobne u wszystkich organizmów, między bakteriami i eukariontami występują pewne istotne różnice. Niektóre z nich wynikają z różnic w budowie komórek obu typów. Bakteryjny mRNA ulega translacji w czasie, gdy jest jeszcze transkrybowany. U eukariontów jest to niemożliwe, gdyż ich chromosomy są zamknięte w jądrze komórkowym, a synteza białek zachodzi w cytosolu. Zanim eukariotyczny mRNA ulegnie translacji, musi przez pory w osłonce jądrowej przedostać się z jądra do cytoplazmy. Między bakteryjnym a eukariotycznym mRNA występuje wiele innych różnic. Bakteryjny mRNA służy do translacji natychmiast po transkrypcji, bez dodatkowej obróbki. U organizmów eukariotycznych powstający prekursorowy mRNA lub pre-mRNA ulega znacznej modyfikacji jeszcze w jądrze komórkowym. Dopiero w wyniku tych modyfikacji potranskrypcyjnych powstaje dojrzała cząsteczka mRNA, gotowa do transportu i translacji. Modyfikacje eukariotycznego mRNA rozpoczynają się, gdy cząsteczka transkryptu osiągnie długość 20-30 nukleotydów.